Rak jelita grubego – profilowanie mutacji
Rozwiązania Agena Bioscience do analizy raka jelita grubego (CRC). Wykrywanie rzadkich mutacji somatycznych w próbkach raka jelita grubego jest trudne, ponieważ:
- materiał biopsyjny jest często mały
- odsetek komórek nowotworowych bywa niski
- nowe wytyczne wymagają rozszerzonego genotypowania RAS i RAF, co zwiększa liczbę analizowanych celów i dodatkowo obciąża próbki
1. UltraSEEK™ Colon Panel
- analiza >100 wariantów mutacji
- czułość do ok. 0,1% MAF
- możliwość pracy na:
- ctDNA (krążące DNA nowotworowe)
- CTC (komórki nowotworowe we krwi)
- materiał: pojedyncza próbka krwi
2. iPLEX® HS Colon Panel
- analiza 86 wariantów
- czułość do ok. 1% MAF
- przeznaczony dla trudnych próbek:
- FFPE
- materiały cytologiczne
- próbki o niskiej jakości DNA
Zakres genów i mutacji (profil CRC)
- UltraSEEK Colon Panel – ~107 wariantów
- iPLEX HS Colon Panel – ~86 wariantów
Obejmuje kluczowe geny:
- KRAS – kodony 12, 13, 59, 61, 117, 146
- NRAS – te same kluczowe regiony co KRAS
- BRAF – V600 (ekson 15) i inne kluczowe kodony
- PIK3CA – E542, E545, H1047 (ekson 9 i 20)
- EGFR – wybrane mutacje domeny zewnątrzkomórkowej
Znaczenie kliniczno-badawcze
Panel umożliwia:
- badanie progresji nowotworu
- analizę mechanizmów oporności na terapię
- wykrywanie mutacji w ctDNA (biopsje płynne)
- profilowanie RAS/RAF zgodnie z aktualnymi wytycznymi
Przebieg analizy
- DNA → wynik w ok. 8 godzin
- minimalna liczba etapów manualnych
- automatyczne raportowanie
- zoptymalizowane dla wysokiej przepustowości laboratoriów
